С 1993 по 2007 годы он замещал должность заместителя главы администрации области. С 2007 по 2009 годы – работал первым заместителем главы региональной администрации. На этом посту Владимир Алфимов обеспечивал реализацию основных направлений государственной политики в области здравоохранения и социальной защиты населения, демографической политики. Глубокие соболезнования в связи с кончиной Владимира Алфимова выразили руководители Правительства области и Новгородской областной Думы.
Прощание с Владимиром Алфимовым состоится 22 декабря в 18:00 в Покровском соборе Великого Новгорода. Похороны пройдут 23 декабря в 12:00 на Западном кладбище.